Le Centre est doté d’un Conseil Scientifique composé, en plus du directeur, de six (6) membres choisis du centre, et éventuellement d’éminentes personnalités scientifiques ou professionnelles nationales et/ou étrangères.
La nomination du directeur du centre est prononcée par décision du Président de l'Université, après avis favorable des membres du Conseil scientifique du centre.
A sa date de création, sont membres du conseil scientifique du centre :
Mr Omar HNICHE, Directeur du centre
Mme Hynd Ayoubi-IDRISSI,
Mr Amal MECHERFI,
Mr Mohammed Rachid AASRI,
Mr Mohammed KHARISS.
Mr Benaceur OUTTAJ,
Mr Radouane RAOUF,
Le Conseil Scientifique du Centre est épaulé dans son fonctionnement par 4 commissions :
Commission "Gouvernance et stratégie",
Commission "Formation et études doctorales",
Commission "Partenariat et valorisation",
Commission "Communication et événementiels",
L'Assemblée du Centre se réunit au minimum une fois par an, sur convocation du Directeurdu Centre, qui la préside, afin d'entendre le rapport du Conseil du Centre sur ses activités scientifiques passées et futures, sur ses comptes et budgets ainsi que sur l'utilisation des moyens qui lui sontaffectés.